Choć leczenie kanałowe mikroskopem jest przeważnie niezwykle precyzyjnym zabiegiem, bywa tak na skutek rozwijających zmian choroby nieuniknione jest powtórne leczenie kanałowe . W znacznej części takich sytuacji najlepiej podjąć próbę ratowania naturalnego zęba. Wyrwanie zęba skutkuje pojawieniem się nieestetycznej luki, jaką powinno się uzupełnić nie tylko z uwagi na piękno uzębienia. Brak zęba wpływa na postępujący zanik kości, a nawet prowadzi do rozchwiania, a nawet wypadania przyległych i przeciwstawnych zębów, którym brakuje odpowiedniego oparcia. Oprócz tego wypełnienie luki zębowej wiąże się z dodatkowym kosztem w postaci protezy. Bez względu na to, czy zdecydujemy się na implant stomatologiczny czy na przykład most , oznacza to następne wizyty w gabinecie stomatologicznym oraz dalsze leczenie.
Z uwagi na to nawet jeśli dany ząb był już leczony wcześniej, warto rozważyć ponowne leczenie kanałowe. Chociaż powtórny zabieg, może być bardziej skomplikowany niż pierwszy, wprawiony dentysta endodonta, dołoży wszelkich starań, aby przeprowadzić zabieg prawidłowo. Wznowione leczenie kanałowe wykonuje się zwykle, kiedy pojawią się kanały niedoleczone przy wcześniejszym zabiegu, ponieważ na przykład nie zostały one wtedy zauważone. Reakcja dentysty endodonty wymagana jest też w sytuacji perforacji korzenia lub komory zęba oraz jeżeli w kanale złamało się narzędzie dentystyczne. Wyrwanie zęba zwykle występuje tylko wtedy, kiedy nie ma możliwości dobrego opracowania kanału.